MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-1+5

Total Repeats: 1596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017394	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017394	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387825485
3	NC_017394	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387825485
4	NC_017394	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387825485
5	NC_017394	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825485
6	NC_017394	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825485
7	NC_017394	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825485
8	NC_017394	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825485
9	NC_017394	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825485
10	NC_017394	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387825485
11	NC_017394	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387825485
12	NC_017394	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825485
13	NC_017394	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387825485
14	NC_017394	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825485
15	NC_017394	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825485
16	NC_017394	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825485
17	NC_017394	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825485
18	NC_017394	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387825485
19	NC_017394	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825485
20	NC_017394	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825485
21	NC_017394	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825485
22	NC_017394	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387825485
23	NC_017394	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825485
24	NC_017394	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825485
25	NC_017394	T	6	6	1058	1063	0 %	100 %	0 %	0 %	387825485
26	NC_017394	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825485
27	NC_017394	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825485
28	NC_017394	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825485
29	NC_017394	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825485
30	NC_017394	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825486
31	NC_017394	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825486
32	NC_017394	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825486
33	NC_017394	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825486
34	NC_017394	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387825486
35	NC_017394	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387825486
36	NC_017394	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387825486
37	NC_017394	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387825486
38	NC_017394	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825486
39	NC_017394	ATT	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825486
40	NC_017394	AATT	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	387825486
41	NC_017394	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387825486
42	NC_017394	A	6	6	2046	2051	100 %	0 %	0 %	0 %	387825487
43	NC_017394	CAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825487
44	NC_017394	T	6	6	2140	2145	0 %	100 %	0 %	0 %	387825487
45	NC_017394	TGG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825487
46	NC_017394	GT	3	6	2160	2165	0 %	50 %	50 %	0 %	387825487
47	NC_017394	CAG	2	6	2168	2173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825487
48	NC_017394	GAG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825487
49	NC_017394	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825487
50	NC_017394	TGG	3	9	2273	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825487
51	NC_017394	GT	3	6	2298	2303	0 %	50 %	50 %	0 %	387825487
52	NC_017394	AAGA	2	8	2379	2386	75 %	0 %	25 %	0 %	387825487
53	NC_017394	TAAAT	2	10	2414	2423	60 %	40 %	0 %	0 %	387825487
54	NC_017394	CA	3	6	2497	2502	50 %	0 %	0 %	50 %	387825487
55	NC_017394	ATTT	2	8	2515	2522	25 %	75 %	0 %	0 %	387825487
56	NC_017394	TGCT	2	8	2527	2534	0 %	50 %	25 %	25 %	387825487
57	NC_017394	TGA	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825487
58	NC_017394	GAA	2	6	2667	2672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825487
59	NC_017394	A	6	6	2736	2741	100 %	0 %	0 %	0 %	387825487
60	NC_017394	TAG	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825487
61	NC_017394	GTT	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825487
62	NC_017394	AGA	2	6	2864	2869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825487
63	NC_017394	TA	3	6	2939	2944	50 %	50 %	0 %	0 %	387825487
64	NC_017394	CTGATA	2	12	2959	2970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825487
65	NC_017394	ATGT	2	8	2989	2996	25 %	50 %	25 %	0 %	387825487
66	NC_017394	TAG	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825487
67	NC_017394	GTAT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	387825487
68	NC_017394	ATAA	2	8	3096	3103	75 %	25 %	0 %	0 %	387825487
69	NC_017394	TTA	2	6	3112	3117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825487
70	NC_017394	TGG	3	9	3125	3133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825487
71	NC_017394	CCA	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825487
72	NC_017394	TAAT	2	8	3145	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	387825487
73	NC_017394	CT	3	6	3162	3167	0 %	50 %	0 %	50 %	387825487
74	NC_017394	CAAT	2	8	3178	3185	50 %	25 %	0 %	25 %	387825487
75	NC_017394	ATCAAG	2	12	3205	3216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387825487
76	NC_017394	TGG	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825487
77	NC_017394	ATT	2	6	3363	3368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825488
78	NC_017394	T	6	6	3478	3483	0 %	100 %	0 %	0 %	387825488
79	NC_017394	ATC	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825488
80	NC_017394	TGG	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825488
81	NC_017394	GAT	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825488
82	NC_017394	AAT	2	6	3703	3708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825488
83	NC_017394	TAG	2	6	3722	3727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825488
84	NC_017394	TAA	2	6	3768	3773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825488
85	NC_017394	CAC	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825488
86	NC_017394	TTTA	2	8	3869	3876	25 %	75 %	0 %	0 %	387825488
87	NC_017394	GTAA	2	8	3907	3914	50 %	25 %	25 %	0 %	387825488
88	NC_017394	GGA	2	6	3931	3936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017394	ATT	2	6	3948	3953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017394	TGA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017394	ATT	2	6	3962	3967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017394	TAA	2	6	4266	4271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017394	TC	3	6	4286	4291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017394	AGT	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017394	ATT	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017394	TTA	2	6	4328	4333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017394	TTCAA	2	10	4359	4368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017394	A	6	6	4377	4382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017394	CTT	2	6	4414	4419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017394	AGA	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017394	TAA	2	6	4458	4463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017394	A	6	6	4487	4492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017394	ATG	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017394	GCA	3	9	4594	4602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017394	GCA	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017394	GGA	2	6	4632	4637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017394	TAA	2	6	4665	4670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017394	AGA	2	6	4674	4679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017394	TTA	2	6	4745	4750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017394	TCAT	2	8	4821	4828	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017394	AGG	2	6	4845	4850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017394	CTA	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017394	A	7	7	4932	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	387825489
114	NC_017394	GAA	3	9	4961	4969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825489
115	NC_017394	TTG	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825489
116	NC_017394	TTAC	2	8	5129	5136	25 %	50 %	0 %	25 %	387825489
117	NC_017394	GTT	2	6	5174	5179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825489
118	NC_017394	GAATTT	2	12	5183	5194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825489
119	NC_017394	A	6	6	5204	5209	100 %	0 %	0 %	0 %	387825489
120	NC_017394	TGAACT	2	12	5221	5232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825489
121	NC_017394	ATT	2	6	5235	5240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825489
122	NC_017394	TAG	2	6	5245	5250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825489
123	NC_017394	GAA	2	6	5261	5266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825489
124	NC_017394	G	6	6	5275	5280	0 %	0 %	100 %	0 %	387825489
125	NC_017394	TG	3	6	5360	5365	0 %	50 %	50 %	0 %	387825489
126	NC_017394	AATG	2	8	5376	5383	50 %	25 %	25 %	0 %	387825489
127	NC_017394	TGT	2	6	5469	5474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825490
128	NC_017394	TTC	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825490
129	NC_017394	AG	3	6	5501	5506	50 %	0 %	50 %	0 %	387825490
130	NC_017394	TTA	2	6	5543	5548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825490
131	NC_017394	TGG	2	6	5792	5797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825491
132	NC_017394	TAG	2	6	5873	5878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825491
133	NC_017394	AT	3	6	5894	5899	50 %	50 %	0 %	0 %	387825491
134	NC_017394	AAT	2	6	5901	5906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825491
135	NC_017394	TA	3	6	5910	5915	50 %	50 %	0 %	0 %	387825491
136	NC_017394	CTA	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825491
137	NC_017394	AAGT	2	8	6041	6048	50 %	25 %	25 %	0 %	387825491
138	NC_017394	GTA	2	6	6058	6063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825491
139	NC_017394	GCA	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825491
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270	NC_017394	A	6	6	12042	12047	100 %	0 %	0 %	0 %	387825499
271	NC_017394	TAC	2	6	12092	12097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825499
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273	NC_017394	CAT	2	6	12151	12156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825499
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